En fait pour freezer c'est assez simple. Il a un background développé, là où les autres ennemis n'en ont quasiment pas:
- Il a détruit la planète Végéta.
- Végéta le connait, il bosse pour lui.
Freezer est donc ancré dans la mythologie des Sayens. Donc de Dragon Ball
D'autre part, la scène se passe dans un univers totalement original (Namek) alors que le reste se passe sur la terre. C'est moins original.
L'arc freezer dure du tome 21 à 28, laissant l'histoire se poser avec de vrais moments de calme. Tandis que l'arc Cell (29-36)est moins centré sur ce dernier qui n'apparait qu'à la fin du tome 30. Rajoute à ça qu'il sort de nul part, ça le rend moins intéressant. Quant à Boo, c'est finalement le plus court, 6 tomes. Et là pareil, le personnage n'est pas ancré dans l'histoire.
Enfin, rajoute à ça le fait que Freezer permet l'apparition du super Sayen, ce qui rend le combat épique, et tu as sans doute la raison du pourquoi il est le plus apprécié.